庆应大学医学部是全球最重要的医学研究机关之一，创建于1917年，它的建立与福泽谕吉的影响密切有关。福泽最早在大阪的医学者绪方洪庵开办的适塾中学医，深知实学的重要，对医学产生浓厚兴趣，并积极支持开办医学。当时从德国归来的世界知名细菌学者北里柴三郎在福泽的要求下出任首届学部长。该部已培养出7,000余名毕业生，他们活跃在世界各地，在医学教育、研究、医疗保健、医务行政等方面均作出了很大贡献。位于信浓汀校区的新建大学附设医院为日本屈指可数的几个最先进医院之一，全部由计算机控制，有360个终端，1071张病床，每日就诊人数可3700多人。
2002年，庆应义塾大学岗野荣之教授和助手成功从各种器官和组织中有效分离出可助器官和组织生长的干细胞。
2003年，日本庆应大学医学系上田政等人用乙肝病毒开发出可适用于基因疗法的新载体，它容易与肝细胞结合。
2005年，庆应大学一个研究小组开发出一种名为“BAXIP”的肽化合物，可用于研制帕金森病等神经变性疾病的治疗药物。
2015年，庆应义塾大学医学部的研究人员在动物实验中发现，一种治疗白血病的药物“依鲁替尼”能遏制脑梗塞病情恶化，有望成为减轻脑梗塞后遗症的新药。
庆应义塾大学费用
本科费用
基本50-60W日元每年，年大概需要25-30W日元的入学金。
分文、理和医学，文科很便宜，理科学费一年120-150W日元，医科大约是400W日元一年。
研究生费用
入学金：35万日元左右
学费：72万日元左右
住宿费：52万日元左右
生活费：以个人情况为准，东京更高。
庆应义塾大学学制介绍
庆应义塾大学在四月份举办入学典礼，开始授课。但是部分本科院系和研究科也可以在九月份入学或毕业。每学年分两个学期，学期4月初到9月末，第二学期9月末到次年3月底。
每学年有三个假期：
暑假为7月底到9月底
寒假为12月底到1月初
春假为2月初到3月底
本科的修读年限是4年，医学则是6年。攻读硕士学位需2年，博士3年。
东京大学
九州大学
北海道大学
名古屋大学
神户大学
筑波大学
岐阜大学
宫崎大学
京都大学
香川大学