兵库县立大学主要有6个学部，11个研究科组成。（其中经营MBA研究科已于2010年4月开设）
学部（本科）主要由理，工，经济，商科，环境人间和看护组成。
研究科主要由理学研究科，工学研究科，经济学研究科，商学研究科，环境人间学研究科和看护学研究科，计算机科学研究科，会计研究科，景观研究科以及MBA研究科组成。
大学院专业设置
|
研究科 |
专业设置 |
|
经济学研究科 |
微观经济学，宏观经济学，现在经济学，动态经济学，计量经济学，数理经济学，数理统计学，经济统计学，经济学史，社会思想史，游戏理论，信息处理，信息系统，计量信息处理，经济政策，金融，财政学，公共经济政策，环境经济学，社会政策论，租税法，经济行政法，国际经济学，国际政治学，贸易政策论，国际金融论，全球化经济论，经济史，西方经济史，日本经济史，中国经济史，中国社会论，亚洲社会论，比较经济社会论 |
|
经营学研究科 |
经营战略，中小企业经营研究，经营决定，组织行动，流通系统，公益企业会计，国际政治蹙额，医疗管理，管理会计，企业论，会计系统，企业法，会计政策，财务诸表分析，租税法，国际经营，低于企业经营，经营信息，会计信息，国际经营，NPO会计，人力资源管理，知识信息，多国际企业 |
|
工学研究科 |
电气系工学、机械系工学、物质系工学 |
|
物质理学研究科 |
物质基础解析学、物质机能解析学、物质构造控制学、物质反应解析学 |
|
生命理学研究科 |
生命科学（生物物质构造解析、生物物质机能解析学、细胞机能解析学、地球环境科学） |
|
环境人类研究科 |
思想·文化、生物·健康、居住、地域、环境·情报、教育、生物多样性、环境战略 |
|
看护学研究科 |
看护学（生涯健康看护、看护基础科学、广域健康看护） |
|
应用信息科学研究科 |
信息科学基础，信息科学应用，数据处理，商务管理基础，政策科学，数据库理论，防灾害信息系统，政策数据解析，国际公共经济学，看护信息，地域信息，电子行政，环境信息 |
东京大学
九州大学
北海道大学
名古屋大学
神户大学
筑波大学
岐阜大学
宫崎大学
京都大学
香川大学