学部学科
海洋科学部（品川校区：东京都港区港南4-5-7）
海洋环境学科
海洋生物资源学科
海洋食品科学学科
海洋政策文化学科
海洋工学部（越中岛校区：东京都江东区越中岛2-1-6）
海事系统工学科 - 船舶运行技术和信息技术，关于海事的所有技术的研究。
海洋电子机械工学科 - 内外航路的设置运用，维护管理的船舶机械师，大型机械品牌的运用?维护管理，海洋能源系统,机器人,电子制御机器的尖端要素?材料的设计?开发等。
流通情报工学科 – 从工学的角度研究在流通中物资流动及其信息。
研究生院
海洋技术科学技术研究科
海洋生命科学（水圈生物科学、生物资源学、海洋生物工学）、食品机能保全科学（食品品质设计学、保健食品科学）、海洋环境保全学（海洋生物学、水圈环境化学、环境系统科学、环境系统工学、国际环境文化学）、海洋管理政策学（海洋政策学、海洋利用管理学）、海洋系统工学（环境技术学、动力系统工学、海洋机械工学、海洋人工智能、海洋探查·利用工学）、食品流通安全管理
海洋科学技术研究科
海洋生命科学专业
食机能保全科学专业
海洋环境保全学专业
海洋系统工学专业
海运物流专业
应用生命科学专业
应用环境系统学专业
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