九州大学继东京大学和京都大学建立后，九州大学于1911年开始设立，当时只设有九州帝国大学医科大学和九州帝国大学工科大学两个学科。1919年除了根据修改“大学令”，将原有的两分科大学改成医学部和工学部，又增设了农学部。以后6年间又增设了法文学部、理学部。
第二次世界大战后日本教育体制进行了彻底的改革，九州帝国大学改为九州大学。不久法文学部一分为三，设立了法学部、文学部、经济学部，并增设了教育学部，同时将福冈高中及久留米工业专科学校并入九州大学。其后，又陆续增设了教养学部、药学部、牙科学部等。
专业设置
人文科学府
人文基础、历史空间论、言语·文学
比较社会文化学府
日本社会文化、国际社会文化
人类环境学府
都市共生设计、人类共生系统、行动系统、教育系统、空间系统
法学府
基础法学、公共·社会法学、民刑事法学、国际关系法学、政治学
经济学府
经济工学、经济系统
理学府
物理学、化学、地球行星科学
系统生命科学学府
系统生命科学
数理学府
数理学
医学系学府
医科学、医学（博士课程）
齿学府
齿学（博士课程）
药学府
医疗药科学、创药科学
工学府
物质创造工学、物质加工工学、材料物性工学、化学系统工学、建设系统工学、都市环境系统工学、海洋系统工学、地球资源系统工学、能源量子工学、机械工学、智能机械系统、航空宇宙工学
艺术工学府
艺术工学、设计策略
系统情报科学府
情报理学、智能系统学、情报工学、电气电子系统工学、电子设计工学
综合理工学府
量子加工理工学、物质理工学、尖端能源理工学、环境能源工学、大气海洋环境系统学
生物资源环境科学府
生物资源开发管理学、植物资源科学、生物机能科学、动物资源工学、农业资源经济学、生产环境科学、森林资源科学、基因资源工学
东京大学
北海道大学
名古屋大学
神户大学
筑波大学
岐阜大学
宫崎大学
京都大学
香川大学